Hanya beberapa minggu setelah Peter Bishop membuat semua perbezaan dan kemudian dibersihkan dari kehadiran, gencatan senjata antara dua alam semesta tetap tidak terganggu dan pelbagai pihak terpaksa bekerjasama. Lincoln Lee bergabung dengan kumpulan Fringe ketika mereka meneliti kes shapeshifter yang dekat dengan rumahnya.